A Terror Háza Múzeum állandó kiállítása a második emeleten kezdődik. Ezen a szinten nyolc kiállítóterem és egy kisebb vetítőterem található. A kiállítás tematikája a magyar totalitárius diktatúrák kronológiáját követi.
Az első terem, amely átvezet az állandó kiállításhoz, a kettős megszállás terme. Ez Magyarország náci és szovjet megszállásával ismerteti meg a látogatókat. Világosan megadtuk azt az időpontot, amikor egy idegen nagyhatalom biztosította a totalitárius diktatúra létrejöttének körülményeit: 1944. március 19., a náci megszállás napja, az a nap, amikor Magyarország elvesztette függetlenségét.
A következő teremben, a magyar nácik (Nyilaskeresztes Párt) átvonulásában a totalitárius diktatúrák kiindulópontját is megjelöltük. Ebben a teremben a teljesen cinikus szlogen: "Tartsatok ki, jövünk!" bevezetője az épület kapcsán kiállított összes borzalomnak. A magyar nácik (Nyilaskeresztes Párt) csarnokában azt a totális, szürreális káoszt és borzalmat próbáltuk reprodukálni, amit a nyilas bérgyilkosok terrorja jelentett az országon belül.
A következő terem a Gulag és szovjet kényszermunkatáborok terme, amely a szovjet kényszermunkatáborokba hurcolt magyaroknak, civileknek és politikai foglyoknak állít emléket. A terem tágassága, a padlót borító térkép, a visszaemlékezések, a falon lévő faburkolat világosan mutatja be 700 000 magyar reménytelen sorsát.
A következő kisebb kiállítóterem az időközben végbement helyi változásokat mutatja be: a Változó ruhák terme.
A háború befejezése után a kezdeti reményekkel ellentétben sem demokrácia, sem piacgazdaság nem jött létre, hanem egy új totalitárius diktatúra és a józan ésszel szemben álló gazdasági rendszer jött létre Magyarországon. A terem közepén forgó installáció a nyilaskereszttel és a kommunista titkosrendőrség egyenruháival a diktatúrák váltakozását és közös magját jelképezi, látszólag egymással szemben állva, de valójában ugyanannak az éremnek a két oldala.
Ezután a látogató az ötvenes évek csarnokában a kiépült kommunista diktatúra mindennapjaiba léphet be. A terem első felében az egypárti "szocialista demokráciára" emlékeztető szavazófülkék állnak; a hivatalos optimizmust és jókedvet idéző környezetet látva láthatjuk azt is, mi zajlott a színfalak mögött: a terem második részének elrendezése a társadalom feletti totális kontrollt jelképezi.
Ezután következik a szovjet tanácsadók terme: ahogy utaltunk a külföldi "Nagy Testvér" jelenlétére a nyilas párt szobájában, itt betekintést nyerhetünk azoknak a szervezeteknek a világába, amelyek Magyarország szovjetizálását felügyelték.
Az utolsó kiállítóteremben egy rendkívül fontos téma kerül bemutatásra, a kommunizmussal szembeni magyar ellenállás sokáig eltitkolt témája. A látogatók helyet foglalhatnak a vetítőteremben, és egész estés korabeli propagandafilmeket nézhetnek.